ED414_DataScienceIntro

Formation pour l'ED 414

Une Demi-journée de 4h

Programme

• outils de maniement des données sous R

notion de pipe, base de grammaire dplyr -- 1h30 presentation des fonctions (filter, select, arrange, mutate, summarize,...) avec exos d'applications sur le jeu utilisé en session 1 merge de tableaux

• exports

export de tableaux de résultats (write.delim, write.csv, ...), export de graphiques (svg, pdf, png,...) -- 30 min export des résumés numériques de l'ensemble du jeu de variable (selon ce qui est vu en session 1) export de graphiques "publication ready" travaillés en session 1

• création de rapports d'analyse automatisés

introduction au markdown, notion de chunk, inline R evaluation,...) -- 2h presentation du Rmarkdown (insertion code R, sortie R, graphiques, selon le modèle cars par défaut dans Rstudio) - et types d'export (pdf, html, word) introduction à kable pour mise en forme des tables

• exercice d'application sur le traitement de données

par ex moulinage d'un fichier csv de sortie d'un lecteur de plaque 96 puits : (linéarité (graphique uniquement?) de la gamme de dilution de la référence, soustraction du blanc, calcul des moyennes ± sd des triplicates, représenations graphiques, tableaux de stats descriptives,..., et montrer que tout est OK avec un autre fichier...)