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Lien vers le Github gmrcB: https://git.unistra.fr/t.fabacher/gmrcfunB

AiresourCourbe.R

[2] “B.mean.R” (jags convertir en stan) -réécrire les sorties -entrée en y~x
[3] “B.moy1.R”
[4] “B.moy2.R”
[5] “B.pois.R”
” (jags convertir en stan) -réécrire les sorties -entrée en y~x

[6] “B.pois1.R”
[7] “B.pois2.R”
[8] “B.prop.R”
” (jags convertir en stan) -réécrire les sorties -entrée en y~x

[9] “B.prop1.R”
[10] “B.prop2.R”

~~ [11] “BayesFactor.R” ~~

[12] “Bland.Altman.R”

Mettre dans l’aide library(blandr)
Le premier qui l’utilise s’y colle

[13] “boxplotm.R”
rajouter (…) rajouter une version gg

[14] “burt.R”
~~[15] “burt_design.R” ~~
[16] “CI.propB.r”
A réécrire, fonction uniquement pour plot
comparer avec fonction dans binom::binom.bayes.densityplot
[17] “coefBIN.R”

[18] “correl.R” rajouter (…) réécrire les sorties ajouter les intervalles de confiances avec choix de la méthode

[19] “correlB.R”
convertir en stan rajouter les mcmc en sortie rendre le graph modifiable Ajouter une fonction qui permet de retourner une matrice de corrélation

~~[20] “cs.R” ~~ remplacer par scale
[21] “cs01.R”
ok
[22] “decoupe.R”
MAJ avec fct Thibaut
[23] “desc.R”

~~[24] “desc.table.R” ~~
Réécrire fonction globale pour sortir un table 1 (regarder tableone)
sd avec n un pour les cliniciens et un pour nous. option pour les différents éléments à afficher

Créer fonction pour recoder quanti/quali
+ En fonction d’une variable de groupe

Fonction comparaison deux groupes bayésien, deux prop : RR, proportion différence, 2IT deux moyennes : moy, diff moyenne, seuil de différence ~~[25] “desc1.R”
[26] “descd.R”
[27] “descr1.R”
[28] “descr3.R”
[29] “descrPKB.R”
[30] “desql.R”
[31] “desqlB.R” ~~ [32] “dessin.temporaire.R”
[33] “extreme.R”
[34] “fisher_multcomp.R”
[35] “gamm.R”
[36] “ggbars.R”
[37] “ggboxplot.R”
[38] “ggcompar.R”
[39] “gghist.R”
[40] “ggpie.R”
[41] “ggpoints.R”
[42] “ggsurv.R”
[43] “ggsurvie.R”
[44] “glmB.R”
[45] “glmB_beta.R”
[46] “glmB_beta_JAGS.R”
[47] “glmB_gamma.R”
[48] “glmB_gamma_JAGS.R”
[49] “glmB_logit.R”
[50] “glmB_logit_JAGS.R”
[51] “glmB_normal.R”
[52] “glmB_normal_JAGS.R”
[53] “glmB_poisson.R”
[54] “glmB_poisson_JAGS.R”
[55] “glmerB_beta.R”
[56] “glmerB_beta_JAGS.R”
[57] “glmerB_gamma.R”
[58] “glmerB_gamma_JAGS.R”
[59] “glmerB_logit.R”
[60] “glmerB_logit_JAGS.R”
[61] “glmerB_normal.R”
[62] “glmerB_normal_JAGS.R”
[63] “glmerB_poisson.R”
[64] “glmerB_poisson_JAGS.R”
[65] “GmrcPlot.R”
[66] “IC.diff.prop.R”
[67] “IC.OR.prop.R”
[68] “IC.RR.prop.R”
[69] “kappaB.R”
[70] “logist.R”
[71] “logistique.variable.bin.R”
[72] “logistique.variable.cont.R”
[73] “mb1.R”
[74] “mergeall.r”
[75] “names2.R”
[76] “norm1.R”
[77] “normal.R”
[78] “occurence.R”
[79] “pb1.R”
[80] “plot.evol2.R”
[81] “plot.R2WB.R”
[82] “plot_Conv_Variables_MAT.R”
[83] “plot_Conv_Variables_MAT_JAGS.R” [84] “plotD.R”
[85] “plotequi.R”
[86] “plotevol.R”
[87] “plotna.R”
[88] “poib1.R”
[89] “prec.R”
[90] “randblock.R”
[91] “rdpv.R”
[92] “Rplots.pdf”
[93] “summaryBY.R”
[94] “table1quali.R”
[95] “table1quanti.R”
[96] “tableaux.R”
[97] “tableauxmod.R”
[98] “transnormBC.R”
[99] “whichNMax.R” Ajouter une fonction Rho ajusté